Přejít na hlavní obsah

OMI-SPEC-130 — Model anotací

Stav: Návrh
Verze: 0.2.0
Starší identifikátor: OMI-SPEC-003
Závisí na: OMI-SPEC-100 (model dokumentu), OMI-SPEC-110 (model odkazu), OMI-SPEC-120 (model vědeckého objektu)


Abstrakt​

Model anotací definuje, jakým způsobem se sémantické informace přiřazují k vědeckým objektům v rámci dokumentu formátu „Open Manuscript Initiative“ (OMI).

Na rozdíl od tradičních textových editorů jsou anotace samostatnými vědeckými objekty. Jsou propojeny se stabilními kotvami, nikoli s pozicemi na stránce, což umožňuje, aby rukopisy zůstaly po celou dobu svého životního cyklu přenositelné, strojově čitelné a nezávislé na konkrétním vydání.

Tento model slouží jako základ pro poznámky, komentáře, vzájemné recenze, návrhy umělé inteligence, redakční pokyny, sémantické citace a budoucí typy anotací.


1. Motivace

Tradiční editory dokumentů považují poznámky za formátovací prvky vázané na vizuální rozvržení.

Tento přístup má značná omezení:

  • při úpravách dochází k přerušení not
  • Komentáře se liší podle konkrétní aplikace
  • Údaje z revizí nelze snadno sdílet
  • Anotace vytvořené umělou inteligencí nelze zachovat
  • formáty publikací vyžadují spíše konverzi než transformaci

OMI nahrazuje tento model sémantickou architekturou.

Anotace jsou přiřazeny k vědeckým objektům – nikoli ke stránkám.


2. Principy návrhu

Anotace MUSÍ:

  • existují nezávisle na rozvržení dokumentu
  • referenční stabilní kotvy
  • přežít strukturální úpravy
  • podpora více vrstev anotací
  • zůstat strojově čitelné
  • zůstat editovatelné ručně
  • být přenositelný napříč publikačními formáty

Anotace NIKDY nepatří k vykreslené stránce.

Patří mezi sémantické objekty.


3. Architektura

Manuscript

├── Metadata
├── Sections
├── Blocks
├── Figures
├── Tables
├── Equations
├── References
├── Notes
└── Annotations

Anotace tvoří samostatnou sbírku.

Objekty dokumentu nikdy neobsahují vložená data anotací.


4. Cílový model

Každá poznámka odkazuje na jeden nebo více kotevních bodů.

Annotation
│
▼
Anchor
│
▼
Scholarly Object

Kotvy jsou definovány v modelu kotev a poskytují stabilní reference i po úpravách.


5. Podporované cíle

Anotace MOHOU být zaměřeny na:

  • rukopis
  • sekce
  • pododdíl
  • odstavec
  • rozsah textu v řádku
  • obrázek
  • oblast obrázku
  • tabulka
  • buňka tabulky
  • rovnice
  • položka v bibliografii
  • odkaz
  • heslo ve slovníčku
  • pole metadat
  • autor
  • komentář k recenzi
  • externí zdroj

Tento seznam MOHOU v budoucnu doplnit další typy objektů.


6. Typy anotací

OMI definuje anotace spíše podle sémantické role než podle způsobu zobrazení.

Poznámky​

  • poznámka pod čarou
  • poznámka na konci textu
  • poznámka autora
  • poznámka redakce
  • poznámka překladatele

Komentáře​

  • komentář
  • odpověď
  • diskusní vlákno
  • vyřešený komentář

Recenze​

  • zásadní revize
  • drobná úprava
  • otázka
  • doporučení
  • schválení
  • zamítnutí

Citace​

  • podporuje tvrzení
  • je v rozporu s
  • souvislosti
  • primární zdroj
  • sekundární zdroj

AI​

  • návrh na přepracování
  • gramatický návrh
  • překlad
  • návrh terminologie
  • ověření faktů
  • varování ohledně konzistence

Vydavatelství​

  • korektura
  • korektura
  • výrobní pokyny
  • pokyny pro sazbu
  • poznámka vydavatele

7. Datový model

Příklad:

{
"id": "annotation-001",

"type": "footnote",

"target": {
"anchor": "anchor-15"
},

"body": {
"content": "The original manuscript contains a different reading."
},

"creator": "orcid:0000-0002-1234-5678",

"created": "2026-07-21T12:00:00Z",

"modified": "2026-07-21T12:10:00Z"
}

8. Více cílů

Jedna anotace MŮŽE odkazovat na více vědeckých objektů.

Příklad:

Paragraph 2

+

Figure 5

+

Table 3

Díky tomu může jedno vědecké vysvětlení popsat několik souvisejících objektů najednou.


9. Rozsáhlá těla poznámek

Těla anotací jsou sama o sobě dokumenty typu „OMI“.

Anotace proto MOHOU obsahovat:

  • formátovaný text
  • odkazy
  • matematické výrazy
  • čísla
  • tabulky
  • sémantické odkazy
  • vnořené anotace

Anotace se neomezují pouze na prostý text.


10. Stabilní ukotvení

Anotace NESMÍ záviset na:

  • čísla stránek
  • vypočítané souřadnice
  • vizuální uspořádání

Místo toho odkazují na stabilní kotvy definované v dokumentu OMI-SPEC-110.


11. Vykreslování

Zobrazení závisí na rendereru.

Stejná anotace se může zobrazit jako:

VýstupZobrazení
HTMLVyskakovací okno
PDFPoznámka pod čarou
EPUBPoznámka na konci textu
DOCXPůvodní poznámka pod čarou
JATS XML<fn>
Recenze webuKomentář v postranním panelu

Samotný rukopis se nikdy nemění.

Mění se pouze zobrazení.


12. Spolupráce

Anotace podporují spolupráci.

Každá anotace uchovává vlastní:

  • tvůrce
  • časová razítka
  • historie revizí
  • stav
  • oprávnění

To umožňuje:

  • společné psaní
  • recenze odborníků
  • redakční procesy
  • Úpravy s podporou umělé inteligence

13. Rozšiřitelnost

Vydavatelé a tvůrci softwaru MOHOU zavést další typy anotací.

Příklady:

  • právní upozornění
  • taxonomické anotace
  • lingvistická analýza
  • poznámka k historickému zdroji
  • chemické varování
  • klinické pozorování

Vlastní typy anotací BY MĚLY deklarovat svou sémantickou roli, aby byla zachována interoperabilita.


14. Vztah k ostatním specifikacím

Tato specifikace závisí na:

  • OMI-SPEC-100 — Model dokumentu
  • OMI-SPEC-110 — Model kotvy
  • OMI-SPEC-120 — Vědecký objektový model

a tvoří základ pro:

  • OMI-SPEC-200 — Testovací model
  • OMI-SPEC-190 — Model spolupráce a oprávnění
  • OMI-SPEC-210 — Model citace
  • OMI-SPEC-230 — Model publikování

15. Historie změn

  • 0.2.0 — Přeneseno z dočasné adresy OMI-SPEC-003 na definitivní adresu OMI-SPEC-130 a opraveny závislosti.

16. Filozofie

V systému „OMI“ jsou anotace plnohodnotnými vědeckými objekty.

Poznámka pod čarou, připomínka z recenze, pokyn redakce, návrh generovaný umělou inteligencí či sémantická citace – to vše jsou příklady téhož pojmu:

Sémantický vztah opírající se o pevný vědecký základ.

Díky oddělení obsahu, vztahů a prezentace umožňuje systém „OMI“ vytvářet skutečně přenositelné vědecké rukopisy, které se mohou vyvíjet v průběhu psaní, recenzování, publikování, uchovávání a opětovného použití, aniž by došlo ke ztrátě sémantického významu.