Преминете към основното съдържание

OMI-SPEC-100 — Модел на документа

Статус​

Чернова

Версия: 0.1.0

Старият идентификатор: OMI-SPEC-001


Цел

Стандартът „Open Manuscript Initiative“ (OMI) дефинира семантичен модел на документа, създаден специално за научната комуникация.

За разлика от традиционните текстови редактори, „OMI“ разделя научното съдържание от визуалното представяне. Авторите описват какво означава информацията, а не как трябва да изглежда тя.

Моделът на документа служи като обща основа за създаване, рецензиране, публикуване, съхранение и автоматизирана обработка.


Принципи на проектирането

Моделът на документа се основава на следните принципи:

  • Семантиката на първо място
  • Независима от платформата
  • Разбираем за човека
  • Подходящ за машинна обработка
  • Разширяем
  • Съвместим
  • Достъпен
  • Подлежи на дългосрочно съхранение

Многослойна архитектура

Моделът на документа „OMI“ се състои от няколко слоя.

┌──────────────────────────────────────────────┐
│ Discipline Profiles │
├──────────────────────────────────────────────┤
│ Scholarly Objects │
├──────────────────────────────────────────────┤
│ Core Document Model │
└──────────────────────────────────────────────┘

Основният модел на документа остава непроменен във всички дисциплини.

По-висшите слоеве разширяват основната спецификация, но никога не я заменят.


Основен модел на документа

Всеки ръкопис в „OMI“ съдържа общ набор от семантични обекти.

Метаданни​

  • Заглавие
  • Подзаглавие
  • Автори
  • Членство
  • ORCID
  • Резюме
  • Ключови думи
  • Език
  • Лиценз
  • Финансиране
  • Постоянни идентификатори

Структура на документа​

  • Раздел
  • Подраздел
  • Абзац
  • Цитат
  • Списък
  • Фигура
  • Таблица
  • Подпис
  • Уравнение
  • Приложение

Научни обекти​

  • Източник
  • Библиография
  • Бележка под линия
  • Заключителна бележка
  • Препратка
  • Набор от данни
  • Софтуер
  • Допълнителни материали
  • Коментар към рецензията
  • Анотация

Профили по дисциплини

Различните научни дисциплини изискват специализирани семантични обекти.

OMI разширява основния модел на документа чрез профили по дисциплини.

Профилът добавя нови типове обекти, правила за валидиране, метаданни и поведение при експортиране, без да променя основния модел на документа.

Примери за това са:

  • История
  • Теология
  • Лингвистика
  • Математика
  • Физика
  • Химия
  • Биология
  • Медицина
  • Информатика
  • Инженерство
  • Икономика
  • Право

Пример: Профил „История“

Профилът „История“ въвежда специфични за дадената област семантични обекти, като например:

  • Архивен източник
  • Историческа личност
  • Историческо място
  • Историческо събитие
  • Източник на ръкописа
  • Регест
  • Критически апарат
  • Дипломатична транскрипция

Пример: Профил „Математика“

Профилът „Математика“ разширява модела със:

  • Определение
  • Аксиома
  • Теорема
  • Лема
  • Следствие
  • Доказателство
  • Формула
  • Регистър на символите

Пример: Профил „Физика“

Допълнителните семантични обекти включват:

  • Уравнение
  • Физична константа
  • Измерване
  • Единица
  • Инструмент
  • Експеримент
  • Симулация

Пример: Профил по химия

Допълнителните семантични обекти включват:

  • Молекула
  • Съединение
  • Reactйон
  • Кристална структура
  • Спектър
  • Химична формула

Пример: Профил по биология

Допълнителните семантични обекти включват:

  • Видове
  • Таксономична класификация
  • Ген
  • Протеин
  • ДНК-последователност
  • Образец

Пример: Профил на лекарство

Допълнителните семантични обекти включват:

  • Клинично изпитване
  • Група пациенти
  • Намеса
  • Резултат
  • Одобрение от етичната комисия
  • Контролен списък CONSORT

Няколко профила

Научните изследвания стават все по-интердисциплинарни.

Поради това един ръкопис от типа „OMI“ може да използва няколко профила по дисциплини едновременно.

Пример:

History
+ Computer Science
+ Linguistics

или

Biology
+ Computer Science
+ Statistics

Всеки профил добавя допълнителни семантични обекти, като същевременно остава напълно съвместим с основния модел на документа.


Архитектура на плъгините

Профилите за дисциплини са реализирани като плъгини.

OMI Core

│

├── History Profile

├── Mathematics Profile

├── Physics Profile

├── Medicine Profile

├── Law Profile

└── Custom Profile

Всеки плъгин може да дефинира:

  • допълнителни семантични обекти
  • метаданни
  • правила за валидиране
  • съответствия при експортиране
  • разширения на потребителския интерфейс

без да се променя ядрото на OMI.


Обектно-ориентиран модел

Един ръкопис в формат „OMI“ се състои от семантични обекти.

Document
│
├── Metadata
├── Sections
├── Paragraphs
├── Figures
├── Tables
├── Citations
├── Bibliography
├── Annotations
├── Review Layer
└── Discipline Objects

Всеки обект има:

  • уникален идентификатор
  • семантичен тип
  • метаданни
  • взаимоотношения
  • история на версиите

Семантични връзки

Обектите могат да се позовават един на друг.

Примери за това са:

  • цитат → запис в библиографията
  • фигура → надпис
  • теорема → доказателство
  • архивен източник → хранилище
  • лице → ORCID
  • набор от данни → DOI

Връзките са ясно дефинирани и могат да бъдат разчетени от компютър.


Разширяемост

Моделът на документа е проектиран с оглед на дългосрочното му развитие.

В бъдещи версии може да бъдат въведени допълнителни типове обекти, без това да наруши съществуващите ръкописи.

Обратната съвместимост е основно изискване при проектирането.


Бъдещи задачи

Бъдещите спецификации ще определят:

  • Модел за анотиране
  • Модел за преглед
  • Модел за цитиране
  • Модел на метаданните
  • Модел на публикуване
  • Плъгин „API“
  • Спецификация на файловия формат

Хронология на промените

  • 0.1.0 — Прехвърлено от временния адрес OMI-SPEC-001 към основния адрес OMI-SPEC-100.

Обобщение

Моделът на документа „OMI“ е създаден с цел да представя научни знания, а не форматирани документи.

Стабилният основен модел на документа, съчетан с разширяеми профили за научни дисциплини, позволява на платформата „OMI“ да поддържа всяка научна дисциплина, като същевременно осигурява оперативна съвместимост, преносимост и дългосрочна устойчивост.